1-      مدیریت و هدایت پژوهشکده برای انجام امور محوله و دستیابی به اهداف در چارچوب اساسنامه و ضوابط و مقررات و مصوبات شورایعالی پژوهشکده

2-      پیشنهاد اعضای شورای پژوهشی پژوهشکده جهت تایید به شورایعالی پژوهشکده

3-      صدور احکام شورای پژوهشی

4-      پیشنهاد روسای مراکز تحقیقاتی تحت پوشش جهت تایید توسط معاونت تحقیقات و فناوری و صدور حکم توسط رئیس دانشگاه

5-      صدور احکام معاونین و مدیران اجرایی پژوهشکده

6-      صدور احکام معاونین پژوهشی و شورای پژوهشی

7-      ارائه گزارش عملکرد سالانه و گزارش های درخواستی به شورایعالی و در صورت نیاز معاونت تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی

8-      امضای اسناد مالی و اداری در چارچوب آیین نامه مالی و معاملاتی دانشگاه

9-      عقد قرارداد و پیگیری و اجرای پروژه های تحقیقاتی با سایر پژوهشکده ها، مراکز تحقیقاتی، دانشگاه ها و سازمان های داخلی وبین المللی خارجی

10-  تنظیم بودجه سالانه و تفصیلی پژوهشکده

11-  پیشنهاد استخدام اعضای هیات علمی پژوهشکده به شورایعالی جهت تایید و طی مراحل قانونی

12-  نظارت بر عملکرد روسای مراکز تحقیقاتی تحت پوشش، معاونین، مدیران و مسئولین واحدهای پژوهشکده جهت حسن اجرای وظایف محوله

13-  تهیه طرح های توسعه و گسترش پژوهشکده با هماهنگی معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه برای بررسی در شورایعالی و درصورت تصویب اجرای طرح ها با هماهنگی معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه

14-  تهیه برنامه عملیاتی سالیانه پژوهشکده در ابتدای هرسال و ارائه به شورایعالی جهت تصویب و اجرا

15-   دریافت و بررسی گزارش عملکرد سالیانه روسای مراکز تحقیقاتی تحت پوشش و اعمال سیاست های تشویقی برای مراکز دارای عملکرد بهتر

16-  تعیین نیازهای استخدامی پژوهشکده و اعلام به شورایعالی جهت تصویب و انجام اقدامات قانونی برای استخدام پرسنل موردنیاز

17-  نظارت بر عملکرد شورای پژوهشی به عنوان رئیس این شورا

18-  معرفی اعضای هیات علمی و پژوهشگران جهت صدور حکم به رئیس دانشگاه( شامل محققین تعهد خدمت و پسا دکترا)