مرکز تحقیقات بیماری­های عفونی دانشگاه علوم پزشکی کاشان مستقر در بیمارستان شهید بهشتی (دومین مرکز بزرگ درمانی در استان اصفهان) در سال 1394 با کسب موافقت اصولی تاسیس شده است. این مرکز به منظور ارتقاء سطح علمی و معیارهای درمانی بیماری­های عفونی شهرستان و کشور و برنامه ­ریزی جهت کنترل بیماری­های واگیر منطقه تشکیل گردیده است تا نهایتا منجر به ارتقاء سطح استاندارد مراقبت­های بهداشتی و کنترل اپیدمی­ها و تبعات اقتصادی و اجتماعی آن شود.